责军事技能、武器、武举、征兵、训练、卫戍、品级、俸禄军队相关政务。

交通司：负责车马、船舶、道路、港口、码头、驿站管理。

建设司：负责官方庙坛、宫府、城郭、仓库、营房、道路、码头、陵寝、坟茔等设施的营建事务。

都水司：负责河流、湖泊、航道、水文、水库、水坝、桥梁、船只的勘察记录管理和修缮事务。

工商司：负责制定工商业发展规划，负责工厂和商行的登记和管理，负责市场监督和管理，负责专利登记和保护等工商业事务。

刑狱司：负责起草和修订律令，承担官方的公正和鉴定事务，负责讼师和监狱的管理，但不再负责审判。

审理司：负责审判，承担事实上的王国法院体系的管理职责

卫生司：负责国家医疗、卫生事务管理，负责医生和医院相关事务。

储备司：负责金银、矿产、钢铁、粮食等战略资源的整合储备，负责筹备金本位纸钞发行事务。

警卫司：负责民间公共安全事务，交通指挥和治安管理，官方公务安保警戒、案件侦破搜查、抢险救灾和应急处理等警察系统的工作。

情报司：情报收集和处理，情报相关的保卫和防御工作。

科学司：除了常规官员之外，专门设博士职务，以官方和的著名学者和工匠们充任。

博士不定员，由朝廷出资供养，专职从事科技、工程、文化方面的研究，本身品级以成果和贡献定。

吴王实验室工匠们，朱简烜的真传弟子们，都被放进了科学司当博士。

部门机构基本确定之后，朱简烜看着手上的人员履历表，将原本职务与现在吴国个部门有一定关联性的官员，安排到各个清吏司署理职务。

根据后续情况决定是否原地转正。

所有清吏司主官郎中，品级暂定正五品，是大明清吏司郎中的正常品级，与秘书府的秘书们平级。

所有郎中全部由吴王本人亲自任命，也全部只听命于吴王。

在地方上，开始整合灾民组成的临时护卫军团，逐步改编为正常的民事机构——县。

暂定每四个护卫军团的人员组成一个县。

若是一个地方驻扎的军团数量不到四个，说明当地情况比较特殊，也按照一个县的规格组建。

瀛洲和白云两片群岛都只有两个护卫，也各自组建一个县。

南澳群岛只有一个卫，也设立一个县。

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