与部分支持丰臣家的大名开始有所行动，以打倒德川家康为目的，7月18日包围伏见城，并开始进行攻击。

8月1日西军攻下了伏见城，7月24日德川家康在小山的时候，斥候汇报了石田三成起兵的举动。德川家康在7月25日进行小山评定，大部分的随行大名支持德川家康的行动，并立即折返到江户城。

德川家康回到江户城，并派遣先锋部队在东海地方及东近畿地方交战。德川家康在9月1日出发，9月14日到达美浓。9月15日双方在关原交战，最初的形势对东军不利，西军逐步进迫到阵；不过到了中午左右，西军的小早川秀秋受到德川军恐吓射击后叛变支持东军，形势得以扭转。最后东军在此场战争取胜，自此权力落在德川家手中。

战后，德川家康积极处理政务，调配大名间的领土，而且经常在京都活动。为了成为将军，他尝试将德川氏的系谱改变（其实从松平改为德川时就早已改变了）。

1603年，朝廷中的使者到达伏见城，德川家康出任征夷大将军，并创立江户幕府，也称为德川幕府，同年将千姬嫁给丰臣秀赖以示友好。

1605年，德川家康退位给三男秀忠，被一般人称为大御所。德川家康表面上在骏府城隐居，但实际上德川家康仍然掌握了大权，在冈大八事件和大久保长安事件之中均由德川家康作主导。

1614年方广寺钟铭事件中，德川家康藉口钟铭内有对自己不利的句，尝试迫使秀赖完全臣服。但是丰臣方摆出备战的姿态，丰臣军积极招募浪人，加强军备，但却没有大名加入大阪方（除了阿波的蜂须贺家政但被家督至镇劝说而放弃举兵），致使德川家康下令大名准备攻击大坂城。

德川军在11月15日开始进行攻击，并步步进迫，迫使丰臣的军队撤回大坂城内，12月4日前田军和松平军擅自攻击真田丸，遭到真田信繁的猛烈反抗，结果大败。

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