将提郑芝虎为提督同知，担任南洋水军主将，提郑兴、郑明为总兵，担任南洋水师副将。

至于郑彩，就只能让他先跟着郑成功了，主要负责教导郑成功海战知识，同时也负责保护郑成功出行安全，也是总兵衔，不过手下没有五万水军，朱慈炅只是给他配了一千锦衣卫，如果郑成功要来东大营学习水军操练，就由他负责陪同保护。

水师至此就算是组建完成了，虽然风帆战列舰还没有造出来，但两大水师至少可以开始统一操练了，福船也可以开始改装了，至于左轮半自动步枪和左轮手枪，等王恭厂那边造出来，也可以慢慢给他们装备了。

鉴于大明沿海最近并没有什么安全隐患，朱慈炅干脆令北洋水师和南洋水师全部驻扎在东大营操练，边熟悉舰炮的操作，边改造福船，等风帆战列舰一造出来，两大水师差不多就能形成战力了，到时候，东瀛和荷兰入侵者什么的就要小心了，朱慈炅早就看他们不顺眼了，大明也已经忍他们很久了！