在占领利马之后，负责指挥军队的李素和徐子长立刻派遣军队追击，这些军队包括了骑兵步兵和少量轻便火炮，以荣耀旅为骨干，义从师为主力，配备大量本地招募的仆从军队，前往内陆的各个城镇。

这些军队对待各级行政区的政策并不完全相同，对付一些种植园，他们的政策与对待印第安部落一样，只收拾领头的卡西克，抄其全家，车辆骡马火药武器这类军队能用的直接收用，类似土地、房产这些直接卖给本地人，而种植园或者印第安部落之中财产在前十位的必须购买。

而对付一个人口聚集的城镇，军队不会入城劫掠，而只是把矛头对准大地主、官僚和乡绅，对其抄家之后，就地拣选本地人建立秩序，缴纳军税。在小镇和农村，军队根本不破坏秩序，只有在城市，会把矛头对准所有的白人，解放黑奴和印第安人，进行大规模的追索。

在托马斯和安东尼奥看来，这根本不是建立秩序，取得西班牙人的办法，更像是更有效率计划性更强的海盗。